Nachdem der Söldner Sub-Zero Hanzo Hasashis Familie brutal ermordet hat, wird Hanzo ins düstere Netherrealm verbannt. Der Dämon Quan Chi bietet ihm die Chance auf Rache – im Gegenzug für seine Dienste. So kehrt Hanzo als Scorpion zurück. Währenddessen versammelt Lord Raiden in Earthrealm ein außergewöhnliches Team, um die Menschheit vor der Vernichtung zu bewahren: den Shaolin-Mönch Liu Kang, die Offizierin Sonya Blade und den Actionstar Johnny Cage. Gemeinsam müssen sie Shang Tsungs Kämpfer aus Outworld besiegen und das Mortal Kombat für sich entscheiden.