Die Mission geht weiter: Ethan Hunt und sein Team von der legendären Impossible Mission Force (IMF) stehen erneut einer übermächtigen künstlichen Intelligenz gegenüber – der „Entität“, die eine Gefahr für die ganze Welt darstellt. Um sie aufzuhalten, müssen sie das russische U-Boot Sewastopol aufspüren, das in dem eskalierenden Konflikt eine entscheidende Rolle spielt.

Doch Hunt und seine Crew sind nicht die Einzigen, die nach dem U-Boot suchen. Auch Gabriel, ein Verbündeter der Entität, will die Sewastopol unbedingt finden. Für ihn ist sie der Schlüssel, um eine Katastrophe auszulösen und die Welt ins Chaos zu stürzen. Im erbitterten Duell mit Hunt scheint Gabriel zudem einen entscheidenden Vorteil zu haben: Zwischen den beiden gibt es eine gemeinsame Vergangenheit, die den IMF-Agenten nun einholt.