In einem japanischen Atomkraftwerk ereignet sich eine verheerende Katastrophe. Der amerikanische Ingenieur Joe Brody überlebt, doch die Ursache des Unglücks lässt ihn auch Jahre später nicht los. Bei seinen Nachforschungen scheint sich sein Verdacht zu bestätigen: Ein gigantisches Monster war für die Zerstörung verantwortlich – und nun ist es zurück. Gemeinsam mit seinem Sohn Ford und dem Wissenschaftler Ichiro Serizawa versucht Joe, die Gefahr zu verstehen. Während das Militär dem Wesen kaum etwas entgegensetzen kann, bleibt eine entscheidende Frage: Kann der legendäre Godzilla die Menschheit retten?