Als Alice in einem Labor der Umbrella Corporation erwacht, ist sie mit dem T-Virus infiziert. Doch sie verwandelt sich nicht in einen Zombie: Stattdessen verfügt sie über übermenschliche Stärke, enorme Schnelligkeit und außergewöhnlich geschärfte Sinne. Mit diesen biogenetischen Fähigkeiten kämpft Alice gemeinsam mit Jill, einer abtrünnigen Umbrella-Agentin, ums Überleben. Im verwüsteten Raccoon City müssen die beiden den hungrigen Untoten, den Umbrella-Soldaten und der Stadt selbst entkommen. Doch ein besonders gefährlicher Gegner stellt sich ihnen in den Weg: der Supermutant Nemesis.