In der Zukunft stehen die Mutanten kurz vor ihrer Auslöschung: Die Sentinels, tödliche Kampfroboter, machen Jagd auf sie. Angesichts dieser Bedrohung verbünden sich die einstigen Rivalen Magneto und Charles Xavier. Gemeinsam wollen sie verhindern, dass die Sentinels überhaupt entstehen. Mithilfe von Kitty Pryde schicken sie Wolverines Bewusstsein in die Vergangenheit – sein Geist kann die Belastungen der Zeitreise überstehen. Dort soll er eine entscheidende Tat Mystiques vereiteln, die den Weg für den Bau der Roboter ebnete. Gelingt der Eingriff, könnte sich die Zukunft zugunsten der Mutanten verändern. Zunächst muss Wolverine jedoch ein Team aus Mutanten versammeln. Das gestaltet sich schwierig, denn der junge Charles Xavier befindet sich in einem äußerst labilen psychischen Zustand.