Die Ankündigung eines „Heilmittels“ für Mutanten bringt das friedliche Zusammenleben von Menschen und Mutanten ins Wanken. Magneto nutzt die aufkommende Unruhe, um einen Krieg gegen die Menschen zu beginnen und die Vorherrschaft an sich zu reißen. Professor Xavier und die X-Men stellen sich ihm entgegen – mit dem Ziel, Magnetos Pläne zu stoppen und Frieden sowie Gleichgewicht wiederherzustellen.