Die beiden Schüler Taku und Yutaka sind beste Freunde und besuchen gemeinsam die Schule in der kleinen Stadt Kochi. Ihr Alltag verändert sich, als Rikako aus der Großstadt zuzieht, um ihre Highschool-Ausbildung in Kochi fortzusetzen. Die attraktive und ehrgeizige Schülerin wird schnell Klassenbeste, doch ihre selbstbewusste, bisweilen überhebliche Art sorgt dafür, dass sie von den anderen Mädchen gemieden wird. Yutaka fühlt sich trotzdem zu ihr hingezogen und verliebt sich in sie. Als schließlich das Gerücht aufkommt, Taku und Rikako seien ein Paar, gerät die Freundschaft zwischen Taku und Yutaka ins Wanken. Flüstern des Meeres – Ocean Waves erzählt einfühlsam vom Alltag japanischer Jugendlicher und davon, wie herausfordernd der Weg ins Erwachsenenleben sein kann.