Tief auf dem finsteren Meeresgrund befindet sich das Unterwasserlabor Deep Star Six. Seit mehr als sechs Monaten ist die Crew in der beengten Tauchstation eingeschlossen. Ihr Auftrag: eine Raketenabschussbasis am Meeresboden errichten. Für den letzten Bauabschnitt muss eine gewaltige Höhle gesprengt werden. Doch die Explosion hat verheerende Folgen: Sie beschädigt einen Teil der Station und weckt ein gigantisches Unterwasserwesen, wie es die Welt noch nie gesehen hat. Gleichzeitig droht der Reaktor von Deep Star Six zu explodieren. Für die Besatzung beginnt ein verzweifelter Kampf ums Überleben.