Während Captain Kirk, Spock und „Pille“ McCoy ihren Urlaub auf der Erde genießen, kämpft die neue Enterprise noch mit zahlreichen technischen Problemen. Da taucht der Vulkanier Sybok auf und bringt das Schiff unter seine Kontrolle. Er will bis nach Shakari vorstoßen – einem geheimnisvollen Planeten jenseits der bekannten Grenzen des Universums. Sybok ist überzeugt, dort dem Schöpfer allen Lebens zu begegnen. Für Kirk und seine Crew beginnt damit eine außergewöhnliche Reise, die sie weiter führt als jede zuvor.