In einer düsteren, menschenleeren Welt beschützt ein Mädchen mit langem weißem Haar ein Ei. Auf seiner Wanderung durch ein verlassen wirkendes Dorf begegnet es einem Fremden. Zunächst widerwillig, schließen sich die beiden zusammen – wie eine ungewöhnliche Arche Noah.

Der Wanderer erzählt von einer Flut, die 40 Tage und 40 Nächte währte und alles Leben auslöschte. Nur Noah und seine Tiere überlebten. Eine ausgesandte Taube kehrte nie zurück, und mit der Zeit gerieten die Überlebenden in Vergessenheit – bis selbst die Tiere zu Stein erstarrten.

Der Anime erzählt seine Geschichte vor allem durch eindrucksvolle Bilder. Die wenigen Worte des Wanderers und die facettenreiche Orchestermusik ergänzen die stillen, beinahe bewegungslosen Szenen und verleihen ihnen eine besondere Atmosphäre. So entsteht ein fantasievoller Film, dessen geheimnisvolle Handlung sich auch im Kopf des Publikums entfaltet.